O Instituto de Física foi criado em junho de 1981 e era responsável por várias disciplinas de outros cursos de graduação da Universidade Federal de Uberlândia (UFU). Inicialmente era chamado de Departamento de Ciências Físicas (1981-2000), depois Faculdade de Física (2000-2005), em junho de 2005 passou-se a se chamar com o nome atual, Instituto de Física. O primeiro Curso de Graduação do Instituto, Licenciatura em Física, foi criada em 1995. Em 2002 com 24 docentes, iniciou-se o Programa de Pós-graduação em Física com o curso de Mestrado, sendo implantado o Doutorado em 2008. No primeiro semestre de 2005 iniciou-se o segundo Curso de Graduação, o Bacharelado em Física de Materiais.

A partir de 2005, com dois Cursos de Graduação e um Programa de Pós-graduação, vários novos grupos de pesquisa começaram a se formar e assim um processo de consolidação da pesquisa em Física ocorreu. Como resultado, o Programa de Pós-Graduação obteve nota 4 em 2007.

Em 2007 foi criado o Museu de Ciências DICA. O terceiro curso de graduação do instituto ocorreu em 2009 com a criação do Bacharelado em Física Médica.

Em 2011 foi implementado o Campus de Patos de Minas. O instituto é responsável por várias disciplinas de cursos deste campus e conta hoje com 3 docentes locados na cidade de Patos de Minas. Em 2012 outro campus avançado foi implentado pela UFU, o Campus de Monte Carmelo, onde o instituto possui 2 docentes na cidade de Monte Carmelo.

Com a solidificação da pesquisa, formação de recursos humanos e o aumento de docentes, em 2013 o Programa de Pós-Graduação recebeu nota 5 da CAPES.

Atualmente, o Instituto de Física conta com 50 professores efetivos, 13 grupos de pesquisa atuantes em várias linhas teóricas e experimentais da Física da Matéria Condensada, Física Médica e Ensino de Física.